회사가 연말정산업무를 잘못 수행하여 과세관청에 세액을 과소신고.납부한 경우에는 즉시 회사가 수정신고서를 작성하여 과소신고.납부한 세액에 일정금액의 가산세를 가산한 금액을 수정신고.납부하여야 한다(「국세기본법」제45조부터 「국세기본법」제49조). 수정신고 관련 사항은 다음과 같다.

① 수정신고시에는 다음의 서류를 작성하거나 수정하여 제출한다.  
 
② 연말정산신고는 전자신고가 되나 수정신고는 전자신고가 허용되지 않는다(원천징수이행상황신고서 제외). 즉 현재 대부분의 회사에서는 연말정산신고를 전자신고(HTS)를 통해 하고 있으나 수정신고는 전자신고가 허용되지 아