(1) 소득세

연말정산결과 근로자에게 소득세를 징수하여야 하는 경우 2월분 근로소득(중도퇴직자의 경우에는 퇴직하는 달의 근로소득)에서 추가징수한다(「소득세법」제134조 제2항). 이때 해당 세액이 1,000원 미만인 경우 원천징수하지 않으며(「소득세법」제86조), 추가징수하여야 할 소득세가 지급할 근로소득의 금액을 초과할 경우(그 다음 달에 지급할 근로소득이 없는 경우 제외)에는 그 초과하는 세액은 그 다음 달의 근로소득을 지급할 때에 징수한다(「소득세법」제139조).

(2) 농어촌특별세

연말정산의무자가 소득금액을 지급하는 때에 소득세법의 원천징수의 예에 따라 농어촌특별세를 징수한다(