‘종합소득과세표준’이란 종합소득금액에서 소득세법 및 조세특례제한법상 소득공제를 차감한 금액을 말한다(「소득세법」제14조 제2항). 따라서 연말정산의 경우 해당 근로자의 종합소득과세표준은 다음의 금액이 되며(「소득세법 시행령」제196조 제2항), 1원 미만의 끝수가 있을 때에는 이를 계산하지 아니한다(「국고금관리법」제47조 제2항).

• 연말정산대상자가 근로자인 경우

• 근로자만 가능한 소득공제이므로 당연히 소득공제받을 수 있다. 다만, 근로를 제공한 기간 동안에만 공제받을 수 있음에 유의하여야 한다(서이46013-10852, 2002.4.24.). 예를 들어 근로를 제공한 기간 동안에 지급한 의료비는 공제받을 수 있으나, 근로를 제공하지 않은 기간 동안 지급한 의료비는 공제받을 수 없는 것이다.

• 연말정산대상자가 사업자인 경우

• 근로자만 가능한 소득공제이므로 사업자(보험모집인, 방문판매인)는 소득공제받을 수 없다. 즉 해당 소득공제를 제외한 나머지 소득공제만 적용하여 연말정산한다.